Planten resistent maken tegen virussen door uitschakelen van een vatbaarheidsgen
...
maken ook gebruik van CRISPR/Cas om planten resistent te maken tegen virussen. Lees het Abstract en de Introduction goed door van dit artikel. Beantwoord dan de volgende vragen:
13. De auteurs willen met CRISPR/Cas9 een gen uitschakelen. Welk gen?
14. Dit gen is noodzakelijk voor infectie door het virus. Het gen maakt de plant vatbaar, en daarom noemen we dit gen een ‘vatbaarheidsgen’ (susceptibility gene). Is dit een plantengen of een gen van het virus?
...
Also use CRISPR/Cas to make plants resistant to viruses. Read the Abstract and the Introduction of this article. Then answer the following questions:
13. The authors want to disable a gene with CRISPR/Cas9. Which gene?
14. This gene is necessary for infection by the virus. The gene makes the plant susceptible, and therefore we call this gene a 'susceptibility gene'. Is this a plant gene or a gene of the virus?
15. Compare the approach of Zhang et al. (2018)
...
with that of J. Chandrasekaran et al. (2016)
...
16. Hoeveel allelen heeft komkommer van dit vatbaarheidsgen? Wordt de plant resistent als er 1 allel gemuteerd is van dit gen? Waarom noemen de auteurs dit een recessieve resistentie, en niet een dominante resistentie?
17. Bekijk Fig. 1A goed, en lees het bijschrift. Waarom zitten de target-sites van CRISPR/Cas9 in de exonen van het gen, en niet in intronen?
...
by making a series of figures. Use this to show in your poster presentation how in the different articles the virus resistance of the plant is created, using CRISPR/Cas.
16. How many alleles does cucumber have of this susceptibility gene? Does the plant become resistant when 1 allele is mutated of this gene? Why do the authors call this a recessive resistance, and not a dominant resistance?
17. Read Fig. 1A carefully, and read the caption. Why are the target sites of CRISPR/Cas9 in the exons of the gene, and not in the introns?
18. What would happen to the encoded protein if there is a deletion of, for example, 1 base in the DNA of the gene? And what if there is a deletion of 3 bases? How big is the deletion usually in Fig. 1C?
19.
...
The authors made a transgenic cucumber with CRISPR/Cas9.
...
Yet they speak in the title about 'non-transgenic cucumber'. Why?
20. The resistance appears to work against different types of viruses. What will be the similarity between these different types of viruses?