Versies vergeleken

Sleutel

  • Deze regel is toegevoegd.
  • Deze regel is verwijderd.
  • Formattering is gewijzigd.

...

Informatie

Definities

Genomic selection is selectie op een eigenschap die van belang is met een zeer groot aantal genetische merkers die de meeste QTL-loci omvatten die verband houden met de eigenschap.

Een SNP is een polymorfisme van één nucleotide dat wordt veroorzaakt door een mutatie van een enkel nucleotide.

...

Figure1 genomic selection John-20161110-170828.jpgImage Added

De bovenstaande figuur geeft het concept achter genomic selection weer. In de referentiepopulatie worden veel dieren gegenotypeerd en hun fenotypes zijn of worden vastgelegd. Met behulp van deze gegevens worden vergelijkingen (Prediction) ontwikkeld, waarin de relaties tussen de SNP’s en de fenotypische waarde worden vastgesteld, zodat ze de fokwaarden voorspellen. Deze voorspellingsvergelijkingen worden toegepast op een populatie kandidaten waarvan alleen het genotype (de SNPs) bekend zijn en nog niet de fenotypische waarden.

Een complicerende factor is recombinatie tussen SNP’s en QTL’s. Hierdoor neemt de voorspellende waarde van de SNPs af, omdat door de recombinatie het verband tussen de SNP en de QTL verbroken wordt. Dit betekent dat de waarde van dieren in de referentiepopulatie afneemt naarmate het aantal generaties tussen hen en de testpopulatie toeneemt (meer kans op recombinatie gebeurtenissen). En het houdt in dat het wordt aanbevolen om door te gaan met het vastleggen van fenotypische gegevens in toekomstige generaties. Het beste beleid De beste strategie is om de referentiepopulatie continu uit te breiden met DNA- en fenotypische gegevens van nieuwe generaties en de oudste generaties te verwijderen, maar de referentiepopulatie moet wel altijd voldoende (grote) omvang hebben.

Onderliggende pagina's (weergave met onderliggende items)