Doelgroep
De doelgroep zijn derdejaars HBO studenten die voor hun specialisatie/minor verdieping zoeken op het onderwerp van de groene biotechnologie en moleculaire plantenveredeling. Zij hebben behoefte aan kennis over het gebruik van moleculaire technieken voor een aantal toepassingsgebieden waar het bedrijfsleven en onderzoek in Nederland mee bezig is:
Klassieke veredeling (algemeen): populaties, F1 hybriden, dihaploiden
Moleculaire merkers: technieken, genetische variatie en veredeling (MAS, marker-assisted selection), genetische kaarten, QTL mapping en GWAS (genome-wide association analysis)
DNA-sequencen: technieken, en toepassingen (whole genome sequencing (WGS), anchored sequencen, sequence alignment, SNP detectie, genotypering)
Groene Biotechnologie (algemeen)
Opleidingen en studierichtingen:
De volgende opleidingen en studierichtingen zullen de WUR-kennis integreren in hun onderwijs:
Hogeschool Inholland, opleiding Biotechnologie, studierichting Groene Biotechnologie
Hogeschool Van Hall Larenstein (VHL), opleiding Biotechnologie, studierichting Groene Biotechnologie
Hogeschool van Arnhem en Nijmegen (HAN), opleiding Biologisch en Medisch Laboratoriumonderwijs, studierichting Moleculaire Planten Biologie
Wageningen University, de ontwikkelde modules kunnen toegevoegd worden aan bestaande DL-MSc vakken, als integraal onderdeel of als keuzemodules voor specifieke studenten.
Auteurs
Arnaud G. Bovy, Wageningen University and Research - Plant Breeding
A.W. (Sjaak) van Heusden, Wageningen University and Research - Plant Breeding
C.M. (Nelleke) Kreike, Inholland
Arend F. van Peer, Wageningen University and Research - Plant Breeding
Elma M.J. Salentijn, Wageningen University and Research - Plant Breeding
Henk J. Schouten, Wageningen University and Research - Plant Breeding
M.J.M. (René) Smulders, Wageningen University and Research - Plant Breeding
Clemens C.M. van der Wiel, Wageningen University and Research - Plant Breeding
Bronnen
Bolger ME et al. (2018) Plant genome and transcriptome annotations, from misconceptions to simple solutions. Briefings in Bioinformatics 19: 437–449. https://doi.org/10.1093/bib/bbw135 (open access)
Chandrasekaran J et al. (2016) Development of broad virus resistance in non‐transgenic cucumber using CRISPR/Cas9 technology. Molecular Plant Pathology 17: 1140-1153. https://doi.org/10.1111/mpp.12375 (open access)
Ekblom R, JBW Wolf (2014) A field guide to whole-genome sequencing, assembly and annotation. Evolutionary Applications 7: 1026-1042. https://doi.org/10.1111/eva.12178 (open access)
Fierst JL (2015) Using linkage maps to correct and scaffold de novo genome assemblies, methods, challenges and computational tools. Frontiers in Genetics 6: 220. https://doi.org/10.3389/fgene.2015.00220 (open access)
Firdaus F et al. (2012) Resistance to Bemisia tabaci in tomato wild relatives. Euphytica 187:31–45. https://doi.org/10.1007/s10681-012-0704-2 (open access)
Glas JJ et al. (2012) Plant Glandular Trichomes as Targets for Breeding or Engineering of Resistance to Herbivores International Journal of Molecular Sciences 13: 17077 -17103. https://doi.org/10.3390/ijms131217077 (open access)
Jarvis DE et al. (2017) The genome of Chenopodium quinoa. Nature 542: 307-312. https://doi.org/10.1038/nature21370 (open access)
Jiao W-B, K Schneeberger (2017) The impact of third generation genomic technologies on plant genome assembly. Current Opinion in Plant Biology 36: 64-70. https://doi.org/10.1016/j.pbi.2017.02.002
Meyer RS, AE DuVal, HR Jensen (2012) Patterns and processes in crop domestication: an historical review and qualitative analysis of 203 global food crops. New Phytologist 196: 29-48 (free access). https://doi.org/10.1111/j.1469-8137.2012.04253.x
Sedlazeck FJ et al. (2018) Piercing the dark matter, bioinformatics of long range sequencing and mapping. Nature Reviews Genetics 19: 329–346. https://doi.org/10.1038/s41576-018-0003-4
Shendure J et al. (2017) DNA sequencing at 40, past present and future. Nature 550: 345-353. https://doi.org/10.1038/nature24286
Tang H, E Lyons, CD Town (2015) Optical mapping in plant comparative genomics. GigaScience 4: s13742-015-0044-y. https://doi.org/10.1186/s13742-015-0044-y (open access)
Van Dijk EL et al. (2018) The third revolution in sequencing technology. Trends in Genetics 34: 666-681. https://doi.org/10.1016/j.tig.2018.05.008
Wajid B, E Serpedin (2016) Do it yourself guide to genome assembly. Briefings in Functional Genomics 15: 1–9. https://academic.oup.com/bfg/article/15/1/1/1741842 (open access)
Yandel M, D Ence (2012) A beginner's guide to eukaryotic genome annotation. Nature Reviews Genetics 13: 329–342. https://doi.org/10.1038/nrg3174
Zhang T et al. (2018) Establishing RNA virus resistance in plants by harnessing CRISPR immune system. Plant Biotechnology Journal 16: 1415-1423. https://doi.org/10.1111/pbi.12881 (open access)
Deze wiki is ontwikkeld in opdracht van WURKS (Wageningen UR Knowledge Share)
Bronnen: alle publicaties behorende bij het WURKS project, zoekvraag Groen Kennisnet
Licentie
De wiki is gepubliceerd onder de Creative Commons Naamsvermelding-NietCommercieel-GelijkDelen 4.0 Nederland licentie.
Verwijs in uw publicatie als volgt naar deze wiki
Groen Kennisnet (2019), Green Plant Biotechnology at work. Geraadpleegd op [datum] van [https://wiki-groenkennisnet.atlassian.net/wiki/spaces/GB/overview].
Logo Groen Kennisnet:
