Grond (bron) en leidingwater zullen in principe vrij zijn van ziekteverwekkers. Maar, in de richtlijnen van GLOBAL GAP versie 6 staat omschreven dat monsternames niet plaats moeten vinden bij de oorsprong, maar bij de afnamepunten die het dichtstbij zijn bij de toepassing. Water wordt soms over groter afstanden getransporteerd via slangen, buizen of kanalen en die kunnen ook besmet raken. Als voorbeeld; 100 m buis met de doorsnede van 75 mm kan maximaal 44 liter water bevatten en dit water komt er als eerste op het gewas als de leiding niet vooraf is geleegd. Besmettingen in buizen en slangen kunnen optreden door ophoping van bacteriën, inclusief ziekteverwekkers, en kunnen permanent aanwezig blijven wanneer ze biofilms [kader 8, Biofilm] vormen.
