4.14 Het DNA aflezen: genetische merkers (2024)
Wanneer het DNA is verzameld en geëxtraheerd, moet je een keuze maken tussen de methoden om het DNA te ‘lezen’. Dit is afhankelijk van het beoogde doel. Moet je de DNA-samenstelling op een beperkt aantal plekken in het genoom weten of de volledige sequentie van het DNA op alle chromosomen?
Als genetische merker kan de DNA-samenstelling op een specifieke plaats in het DNA worden gemeten. Een genetische merker heeft een bekende locatie in het genoom. De samenstelling van de genetische merker kan verschillen tussen dieren en zelfs tussen de homologe chromosomen van een dier. Je kunt de allelen van een genetische merker detecteren en vergelijken. Dieren kunnen dus homozygoot of heterozygoot zijn voor de merker. Hier bespreken we alleen de twee merkers die het meest worden gebruikt in de veefokkerij. Deze twee zijn de microsatelliet merker en het single nucleotide polymorphism (de SNP).