6.4 Oorzaken van inteelt

Er zijn twee oorzaken van inteelt: inteelt door genetische drift en inteelt door het niet-random paren van dieren. Met andere woorden: inteelt door het toeval en inteelt omdat we dat willen, respectievelijk onvermijdelijke en vermijdelijke inteelt.

Genetische drift veroorzaakt verlies in genetische diversiteit door het verliezen van allelen, welke tot een toename van homozygositeit leiden en dit wordt ook wel onvermijdelijke inteelt genoemd. Bijvoorbeeld, op een gegeven moment kwam er een mutatie in het genoom van een dier. Je mag dan aannemen dat deze mutatie alleen voorkomt in één enkel dier, omdat het erg onwaarschijnlijk is dat dezelfde mutaties tegelijkertijd voorkomen in meerdere dieren. Dieren die op dit moment de mutatie dragen moeten daarom wel afstammelingen zijn van het dier bij wie de mutatie oorspronkelijk plaatsvond. Dit geldt voor alle mutaties, zelfs als het dier bij wie de mutatie plaatsvond heel lang geleden leefde. Gegeven de definitie dat inteelt het resultaat is van het paren van verwante dieren, moeten dieren die homozygoot zijn voor die mutatie wel het resultaat van inteelt zijn. Homozygositeit in een populatie is een indicatie van de grootte  van allelfrequenties. Als alle dieren homozygoot zijn, dan zijn andere allelen verloren gegaan in de populatie. Inteelt door genetische drift resulteert in een permanent verlies van genetische diversiteit omdat allelen dan voorgoed verloren zijn gegaan.

Niet-random paren kan ook leiden tot inteelt, maar dit is te vermijden. Het bewust paren van verwante dieren, zoals broer en zus of vader en dochter, resulteren in een vergrote kans dat de nakomelingen van de kruising dezelfde allelen van de ouders ontvangen. Dit resulteert in een hogere homozygositeit en dus in inteelt. Echter, dit is een tijdelijk verlies van genetische diversiteit omdat, wanneer je stopt met het bewust paren van familieleden en opnieuw random gaat paren, het resultaat van inteelt verdwijnt. Op populatieniveau heeft bewuste inteelt weinig effect op de allelfrequentie.