/
4.15.1.1 Voorbeeld: afstammingscontrole met 18 microsatellieten bij honden

4.15.1.1 Voorbeeld: afstammingscontrole met 18 microsatellieten bij honden

Bron: “Het fokken van rashonden”, Kor Oldenbroek en Jack Windig, Raad van Beheer op Kynologisch gebied in Nederland).

Twee teven genaamd Marjolein en Martha worden op dezelfde dag in dezelfde kennel geboren. De kenneleigenaar beschouwde Marjolein als de dochter van de teef Lianne en de reu Borus. Volgens hem zijn de ouders van Martha het teef Lieneke en de reu Bart. De twee reuen, Borus en Bart, zijn in eigendom van een naburige fokker. Lianne werd gedekt door Boris op dezelfde dag dat Lieneke werd gedekt door Bart. Zoals gebruikelijk werd, voordat de officiële stamboom werd afgedrukt, een ouderschapscontrole met 18 microsatellietmarkers uitgevoerd om de stamboom te verifiëren.

DNA-onderzoek van alle zes honden wordt gepresenteerd met voor elke microsatelliet het nummer (‘naam’) van de twee waargenomen allelen:

Microsatellite

Marjolein

Lianne

Borus

Martha

Lieneke

Bart

Microsatellite

Marjolein

Lianne

Borus

Martha

Lieneke

Bart

1 AHT 121

102/102

102/102

97/102

97/102

97/102

102/102

2 AHT 137

149/151

147/151

128/147

147/149

149/151

149/151

3 AHTH 171

219/225

219/225

212/233

227/233

227/229

219/219

4 AHTH 260

254/252

254/246

252/250

252/244

244/244

252/244

5 AHTK 211

93/93

93/95

91/95

91/93

93/93

93/97

6 AHTK 253

284/288

288/290

288/288

288/288

286/288

284/288

7 CXX 279

126/126

126/128

124/128

124/128

126/128

124/126

8 FH 2054

152/152

152/164

152/156

156/160

152/160

152/156

9 FH 2848

230/234

234/234

230/230

230/230

230/230

230/234

10 INRA 21

97/101

97/101

95/101

95/101

95/97

95/101

11 INU 005

126/126

126/126

126/128

132/128

132/126

130/126

12 INU 030

144/144

144/150

144/144

144/144

144/150

144/144

13 INU 055

210/214

210/218

210/212

210/216

212/216

214/216

14REN162C04

202/204

200/202

200/204

202/204

200/202

200/204

15REN169D01

212/218

212/212

218/218

214/218

214/218

216/218

16REN169O18

162/164

162/162

164/170

164/170

164/168

164/168

17 247M23

268/268

268/270

268/272

268/268

268/274

268/274

18 54P11

226/226

226/236

226/232

226/226

226/232

226/234

Marjolein heeft voor microsatilliet 1 (AHT 121) allel 102 in tweevoud. Dit allel komt zowel bij Lianne als bij Borus voor. Voor microsatelliet 2 (AHT 137) heeft Marjolein de allelen 149 en 151. Allel 151 is terug te voeren op haar moeder Lianne, maar haar vader Borus (en haar moeder Lianne!) heeft niet allel 149! Voor microsatelliet 3 (AHTH 171) heeft Marjolein de allelen 219 en 225, vergelijkbaar met haar moeder Lianne, maar haar vader Borus heeft de allelen 212 en 233. Als je op deze manier alle allelen gaat controleren op de 18 aanwezige microsatellieten in de zes dieren kun je op basis van de microsatellieten 2, 3, 5, 6, 7, 13 concluderen dat Borus niet de vader van Marjolein kan zijn. Op basis van de allelen van Bart voor de 18 microsatellieten kan het heel redelijk zijn dat Bart de vader van Marjolein.

Gezien de allelen van Martha en Lieneke kun je concluderen dat het heel aannemelijk kan zijn dat zij dochter en moeder zijn. Maar Bart kan op basis van de allelen voor de microsatellieten 2, 3, 5, 11, 13 en 16 niet de vader van Martha zijn.

Een vergelijking van de allelen van Marjolein met de allelen van Lianne en van Bart geeft aan dat Marjolein mogelijk geboren is uit een paring van Lianne en Bart en dat Martha geboren is uit een paring van Lieneke en Boris. Blijkbaar is er iets misgegaan tijdens de paringen, of tijdens de DNA-afname. Uit het opnieuw typeren van de dieren moet blijken of er inderdaad sprake is van een afstammingsfout.

Related content

14.5: De mogelijkheden van DNA-analyse om genetische diversiteit te meten
14.5: De mogelijkheden van DNA-analyse om genetische diversiteit te meten
More like this
4.15.1.2 Afstammingscontrole in genomic selection programma's (2024)
4.15.1.2 Afstammingscontrole in genomic selection programma's (2024)
More like this
4.14 Het DNA aflezen: genetische merkers (2024)
4.14 Het DNA aflezen: genetische merkers (2024)
More like this
4.14.3 SNP of micro? (2024)
4.14.3 SNP of micro? (2024)
More like this
2.1.2 Het verzamelen van informatie voor het schatten van fokwaarden
2.1.2 Het verzamelen van informatie voor het schatten van fokwaarden
More like this
4.14.1 De microsatelliet merker (2024)
4.14.1 De microsatelliet merker (2024)
More like this