4.15.3.1 Voordelen van genomic selection (2024)
Genomic selection maakt het mogelijk om dieren te selecteren op basis van een geschatte fokwaarde voor een kenmerk voordat ze de leeftijd hebben bereikt waarop het relevante kenmerk gemeten kan worden. Het belang hiervan is dat bij traditionele methoden met afstammings- en prestatiegegevens de meest nauwkeurige schatting van de fokwaarde van een individu zonder fenotype, of zonder nakomelingen met fenotypes, voortkomt uit het gemiddelde van de geschatte fokwaarden (EBV's) van zijn of haar eigen ouders. Dit is ongeacht het aantal (volle en half) broers en zussen, neven en nichten met fenotypes, aangezien hun relevante informatie voor de fokwaarde uitsluitend via de vader en de moeder komt. Deze schatting is altijd onvolledig omdat alle variatie die voortkomt uit het Mendeliaanse toevalsproces tijdens de meiose (welke 50 procent van de allelen van de ouder in kwestie wordt doorgegeven aan de nakomeling), niet wordt meegenomen. Dit betreft de helft van de totale genetische variatie. Met voldoende gegevens over genetische merkers kan het Mendeliaanse toevalsproces van ouder naar nakomeling worden vastgelegd en gebruikt worden in evaluaties om de nauwkeurigheid van de geschatte fokwaarde te vergroten. De gewenste nauwkeurigheid ontstaat als er voldoende gegevens in de referentiepopulatie zijn, want dit bepaalt de waarde van de voorspellingsformule. Genomic selection heeft de grootste impact voor 1) leeftijdsgebonden kenmerken, waarbij fenotypes later in het leven bekend worden na het intreden van de puberteit, 2) voor geslachtsgebonden kenmerken zoals de ei- en melkproductie, waarbij informatie alleen afkomstig is van vrouwelijke familieleden, of 3) eigenschappen waarbij een fenotype pas na de slacht kan worden verkregen, zoals karkaskenmerken of 4) bij ziekteweerstand, een kenmerk wat pas gemeten kan worden als er ziektedruk aanwezig is. In praktische fokprogramma's waarbij volle broers en zussen worden geboren, wordt genomic selection toegepast om de verschillen tussen volle broers en zussen als gevolg van het Mendeliaanse toevalsproces vast te stellen. Genomic selection levert voordelen op die kunnen resulteren in een grotere nauwkeurigheid en/of een grotere intensiteit van de selectie en/of kortere generatie-intervallen. In elk van deze gevallen zal dit resulteren in een toename van de genetische vooruitgang. Dit is samengevat in de onderstaande tabel.